קבוצת אנזימים המפרקים מולקולות חלבון לחומצות אמינו בודדות. מלבד חשיבותם של הפרוטאזים בעיכול חלבונים הם אחראים (ביחד עם הפרשות אחרות) שהמעי הדק יהיה חופשי מטפילים (חיידקים, שמרים, חד תאיים ותולעי מעיים), ע"י פירוקם.
מחסור בפרוטאזות יכול לגרום לנדודי שינה וחרדה, ירידה ביעילות מערכת החיסון ,אי סדירות ביציאות, הפרעות עיכול,בעיות בקרישת דם ועוד תופעות הנובעות מאספקה לקוייה של חומצות אמינו.